Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRAP54198 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIRAP54198 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIRAP54198 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIRAP54198 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
HIRAP54198 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIRAP54198 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIRAP54198 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIRAP54198 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRAP54198 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRAP54198 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRAP54198 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRAP54198 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRAP54198 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRAP54198 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRAP54198 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRAP54198 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRAP54198 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRAP54198 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRAP54198 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRAP54198 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRAP54198 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRAP54198 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRAP54198 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRAP54198 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRAP54198 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRAP54198 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRAP54198 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRAP54198 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRAP54198 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRAP54198 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRAP54198 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRAP54198 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRAP54198 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRAP54198 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRAP54198 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRAP54198 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRAP54198 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRAP54198 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRAP54198 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRAP54198 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRAP54198 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRAP54198 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRAP54198 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRAP54198 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRAP54198 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRAP54198 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRAP54198 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRAP54198 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRAP54198 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRAP54198 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRAP54198 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRAP54198 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRAP54198 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRAP54198 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRAP54198 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRAP54198 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRAP54198 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRAP54198 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRAP54198 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRAP54198 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIRAP54198 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIRAP54198 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRAP54198 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRAP54198 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms