Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSR4P51571 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSR4P51571 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SSR4P51571 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms