Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB28P51157 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB28P51157 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms