Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAMP50895 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAMP50895 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAMP50895 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAMP50895 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAMP50895 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAMP50895 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAMP50895 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAMP50895 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAMP50895 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAMP50895 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAMP50895 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAMP50895 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAMP50895 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAMP50895 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAMP50895 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAMP50895 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAMP50895 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAMP50895 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAMP50895 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAMP50895 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAMP50895 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAMP50895 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAMP50895 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAMP50895 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAMP50895 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAMP50895 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAMP50895 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAMP50895 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAMP50895 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAMP50895 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAMP50895 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAMP50895 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAMP50895 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAMP50895 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAMP50895 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAMP50895 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAMP50895 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAMP50895 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAMP50895 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAMP50895 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAMP50895 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAMP50895 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAMP50895 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAMP50895 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAMP50895 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCAMP50895 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCAMP50895 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCAMP50895 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCAMP50895 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCAMP50895 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAMP50895 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAMP50895 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAMP50895 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAMP50895 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAMP50895 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAMP50895 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAMP50895 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAMP50895 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAMP50895 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAMP50895 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAMP50895 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAMP50895 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAMP50895 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAMP50895 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCAMP50895 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms