Protein–RNA interactions for Protein: P49703

ARL4D, ADP-ribosylation factor-like protein 4D, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4DP49703 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL4DP49703 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms