Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A9P48067 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms