Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP5P45974 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP5P45974 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP5P45974 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP5P45974 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP5P45974 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP5P45974 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP5P45974 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP5P45974 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP5P45974 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP5P45974 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP5P45974 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP5P45974 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP5P45974 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP5P45974 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP5P45974 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP5P45974 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP5P45974 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP5P45974 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP5P45974 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP5P45974 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP5P45974 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP5P45974 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP5P45974 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP5P45974 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP5P45974 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP5P45974 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP5P45974 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP5P45974 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP5P45974 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP5P45974 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP5P45974 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP5P45974 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP5P45974 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP5P45974 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP5P45974 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP5P45974 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP5P45974 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP5P45974 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms