Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSG1P42857 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSG1P42857 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NSG1P42857 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSG1P42857 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NSG1P42857 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NSG1P42857 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NSG1P42857 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NSG1P42857 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSG1P42857 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSG1P42857 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSG1P42857 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSG1P42857 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSG1P42857 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSG1P42857 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NSG1P42857 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSG1P42857 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSG1P42857 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSG1P42857 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSG1P42857 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSG1P42857 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSG1P42857 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSG1P42857 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NSG1P42857 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSG1P42857 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSG1P42857 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSG1P42857 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSG1P42857 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSG1P42857 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSG1P42857 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSG1P42857 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSG1P42857 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NSG1P42857 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms