Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP2P42575 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP2P42575 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP2P42575 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP2P42575 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP2P42575 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP2P42575 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP2P42575 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP2P42575 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms