Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT2P35908 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT2P35908 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT2P35908 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT2P35908 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms