Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms