Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB2P35606 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB2P35606 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB2P35606 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB2P35606 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB2P35606 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB2P35606 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB2P35606 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB2P35606 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB2P35606 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB2P35606 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB2P35606 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB2P35606 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB2P35606 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB2P35606 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB2P35606 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB2P35606 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB2P35606 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB2P35606 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB2P35606 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB2P35606 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB2P35606 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB2P35606 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB2P35606 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB2P35606 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB2P35606 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB2P35606 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB2P35606 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB2P35606 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB2P35606 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB2P35606 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPB2P35606 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPB2P35606 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPB2P35606 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms