Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THBS4P35443 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THBS4P35443 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
THBS4P35443 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
THBS4P35443 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
THBS4P35443 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
THBS4P35443 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THBS4P35443 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms