Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCKARP32238 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKARP32238 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKARP32238 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms