Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms