Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP1P29466 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP1P29466 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP1P29466 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP1P29466 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP1P29466 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP1P29466 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP1P29466 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP1P29466 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP1P29466 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP1P29466 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP1P29466 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP1P29466 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP1P29466 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP1P29466 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms