Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NMBRP28336 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMBRP28336 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMBRP28336 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMBRP28336 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMBRP28336 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMBRP28336 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMBRP28336 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMBRP28336 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMBRP28336 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMBRP28336 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMBRP28336 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMBRP28336 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NMBRP28336 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMBRP28336 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMBRP28336 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMBRP28336 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMBRP28336 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMBRP28336 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMBRP28336 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMBRP28336 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMBRP28336 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMBRP28336 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMBRP28336 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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