Protein–RNA interactions for Protein: P28330

ACADL, Long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADLP28330 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADLP28330 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADLP28330 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADLP28330 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADLP28330 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADLP28330 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADLP28330 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADLP28330 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADLP28330 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADLP28330 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADLP28330 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADLP28330 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADLP28330 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADLP28330 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADLP28330 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADLP28330 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADLP28330 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADLP28330 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADLP28330 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADLP28330 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADLP28330 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADLP28330 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADLP28330 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADLP28330 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADLP28330 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADLP28330 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADLP28330 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADLP28330 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADLP28330 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADLP28330 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADLP28330 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADLP28330 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADLP28330 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADLP28330 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADLP28330 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADLP28330 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADLP28330 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADLP28330 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADLP28330 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADLP28330 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADLP28330 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADLP28330 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADLP28330 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADLP28330 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms