Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

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Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHATP28329 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHATP28329 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHATP28329 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHATP28329 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHATP28329 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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