Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX2P28328 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX2P28328 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX2P28328 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX2P28328 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms