Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms