Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms