Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms