Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO1P25800 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LMO1P25800 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LMO1P25800 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
LMO1P25800 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO1P25800 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO1P25800 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO1P25800 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO1P25800 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO1P25800 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO1P25800 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO1P25800 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO1P25800 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO1P25800 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO1P25800 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO1P25800 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO1P25800 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO1P25800 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO1P25800 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO1P25800 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO1P25800 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms