Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYF6P23409 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYF6P23409 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYF6P23409 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYF6P23409 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYF6P23409 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYF6P23409 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYF6P23409 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MYF6P23409 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYF6P23409 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYF6P23409 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYF6P23409 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYF6P23409 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYF6P23409 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYF6P23409 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYF6P23409 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms