Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1P21675 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1P21675 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1P21675 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1P21675 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1P21675 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1P21675 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1P21675 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1P21675 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1P21675 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1P21675 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1P21675 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1P21675 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1P21675 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1P21675 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1P21675 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1P21675 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1P21675 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1P21675 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1P21675 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1P21675 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1P21675 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1P21675 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1P21675 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1P21675 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1P21675 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1P21675 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1P21675 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1P21675 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1P21675 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1P21675 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1P21675 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF1P21675 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF1P21675 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF1P21675 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF1P21675 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1P21675 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1P21675 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1P21675 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1P21675 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1P21675 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1P21675 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1P21675 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1P21675 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1P21675 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1P21675 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1P21675 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1P21675 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1P21675 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms