Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms