Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTRB1P17538 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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