Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MUC1P15941 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MUC1P15941 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MUC1P15941 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MUC1P15941 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MUC1P15941 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MUC1P15941 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MUC1P15941 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MUC1P15941 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MUC1P15941 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MUC1P15941 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MUC1P15941 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MUC1P15941 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MUC1P15941 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MUC1P15941 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MUC1P15941 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MUC1P15941 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MUC1P15941 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MUC1P15941 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MUC1P15941 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MUC1P15941 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MUC1P15941 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MUC1P15941 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MUC1P15941 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MUC1P15941 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MUC1P15941 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MUC1P15941 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MUC1P15941 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MUC1P15941 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MUC1P15941 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MUC1P15941 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MUC1P15941 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MUC1P15941 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MUC1P15941 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MUC1P15941 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MUC1P15941 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MUC1P15941 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MUC1P15941 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MUC1P15941 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MUC1P15941 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MUC1P15941 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MUC1P15941 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MUC1P15941 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MUC1P15941 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MUC1P15941 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MUC1P15941 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MUC1P15941 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms