Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms