Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GP1BBP13224 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms