Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYL1P12980 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms