Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPCP11686 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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