Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLI2P10070 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLI2P10070 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLI2P10070 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLI2P10070 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI2P10070 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI2P10070 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI2P10070 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI2P10070 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI2P10070 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI2P10070 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI2P10070 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI2P10070 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI2P10070 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI2P10070 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI2P10070 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI2P10070 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI2P10070 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI2P10070 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI2P10070 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI2P10070 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI2P10070 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GLI2P10070 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GLI2P10070 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLI2P10070 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLI2P10070 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLI2P10070 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GLI2P10070 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GLI2P10070 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLI2P10070 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLI2P10070 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLI2P10070 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLI2P10070 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLI2P10070 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLI2P10070 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI2P10070 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI2P10070 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI2P10070 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI2P10070 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI2P10070 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI2P10070 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI2P10070 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI2P10070 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI2P10070 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI2P10070 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI2P10070 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI2P10070 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI2P10070 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI2P10070 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI2P10070 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI2P10070 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI2P10070 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI2P10070 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI2P10070 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI2P10070 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI2P10070 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI2P10070 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI2P10070 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI2P10070 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI2P10070 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI2P10070 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI2P10070 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI2P10070 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI2P10070 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI2P10070 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI2P10070 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI2P10070 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI2P10070 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI2P10070 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI2P10070 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI2P10070 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI2P10070 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI2P10070 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI2P10070 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI2P10070 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI2P10070 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI2P10070 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI2P10070 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI2P10070 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI2P10070 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI2P10070 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI2P10070 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI2P10070 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI2P10070 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI2P10070 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI2P10070 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI2P10070 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI2P10070 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI2P10070 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLI2P10070 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLI2P10070 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLI2P10070 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLI2P10070 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLI2P10070 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLI2P10070 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLI2P10070 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GLI2P10070 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLI2P10070 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLI2P10070 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLI2P10070 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms