Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD2P0DJD1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms