Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC166P0CW27 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC166P0CW27 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms