Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTMAP06454 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTMAP06454 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTMAP06454 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTMAP06454 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTMAP06454 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTMAP06454 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTMAP06454 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTMAP06454 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PTMAP06454 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTMAP06454 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTMAP06454 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTMAP06454 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTMAP06454 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTMAP06454 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTMAP06454 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTMAP06454 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTMAP06454 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTMAP06454 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTMAP06454 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTMAP06454 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTMAP06454 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTMAP06454 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTMAP06454 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTMAP06454 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTMAP06454 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTMAP06454 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTMAP06454 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTMAP06454 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTMAP06454 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTMAP06454 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTMAP06454 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTMAP06454 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTMAP06454 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTMAP06454 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTMAP06454 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTMAP06454 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTMAP06454 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTMAP06454 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTMAP06454 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTMAP06454 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTMAP06454 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTMAP06454 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTMAP06454 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTMAP06454 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTMAP06454 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTMAP06454 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTMAP06454 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTMAP06454 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTMAP06454 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTMAP06454 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms