Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNP04198 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNP04198 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNP04198 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYCNP04198 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYCNP04198 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYCNP04198 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYCNP04198 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MYCNP04198 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYCNP04198 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYCNP04198 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYCNP04198 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYCNP04198 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYCNP04198 HGNC:18790-207ENST00000505246 973 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYCNP04198 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYCNP04198 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYCNP04198 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYCNP04198 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MYCNP04198 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYCNP04198 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYCNP04198 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYCNP04198 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms