Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX58O95786 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX58O95786 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX58O95786 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX58O95786 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX58O95786 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX58O95786 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX58O95786 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX58O95786 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX58O95786 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX58O95786 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX58O95786 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX58O95786 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX58O95786 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX58O95786 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX58O95786 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX58O95786 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX58O95786 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX58O95786 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX58O95786 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX58O95786 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX58O95786 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX58O95786 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX58O95786 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX58O95786 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX58O95786 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX58O95786 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX58O95786 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX58O95786 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX58O95786 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX58O95786 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX58O95786 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX58O95786 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX58O95786 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX58O95786 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX58O95786 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX58O95786 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX58O95786 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX58O95786 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX58O95786 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX58O95786 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX58O95786 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX58O95786 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX58O95786 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX58O95786 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX58O95786 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX58O95786 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX58O95786 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX58O95786 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX58O95786 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX58O95786 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX58O95786 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX58O95786 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX58O95786 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX58O95786 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms