Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms