Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24DO94855 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms