Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms