Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRMUO75648 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRMUO75648 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRMUO75648 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRMUO75648 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRMUO75648 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRMUO75648 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRMUO75648 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRMUO75648 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRMUO75648 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRMUO75648 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRMUO75648 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms