Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms