Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX16O60231 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX16O60231 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX16O60231 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX16O60231 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX16O60231 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX16O60231 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX16O60231 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX16O60231 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX16O60231 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX16O60231 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX16O60231 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX16O60231 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX16O60231 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX16O60231 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX16O60231 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX16O60231 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX16O60231 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX16O60231 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX16O60231 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX16O60231 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX16O60231 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX16O60231 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX16O60231 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX16O60231 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX16O60231 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms