Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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