Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBDO15205 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBDO15205 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms