Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1BO15143 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms