Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MCRIP1C9JLW8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms