Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms